En joyeria es importante saber diferenciar tanto las perlas naturales de las cultivadas, como de sus imitaciones, pues sus precios varian de manera sustancial. El aspecto externo de las perlas naturales y cultivadas es similar, por lo que son necesarios metodos más sutiles de identificación.
Uno de ellos es la medición de la densidad: las perlas naturales suelen presentar una densidad inferior a 2, 73, mientras que la mayor parte de las perlas obtenidas por cultivo superan este valor.
Otro método eficaz sería la determinación de su estructura interna; la conformación interior de las perlas cultivadas depende del tipo de núcleo, mientras que en las naturales suele ser concéntrica.
Por último, citaremos el método del examen radiográfico: las perlas cultivadas, al ser irradiadas con rayos X presentan una luminosidad de tonos verdes, y amarillenta si son irrradiadas con luz ultravioleta.